如果说,生命是一本天书,那么DNA双螺旋结构的发现告诉了我们这本天书的密码,而一代测序的发明给我们指明了解锁人类密码的钥匙。一代测序因发明它的科学家Frederick Sanger又被称为Sanger测序,他也因此获得1980年的诺贝尔化学奖,他也成为两度获得诺贝尔化学奖的科学家之一。
Sanger测序法的原理是基于四种脱氧核苷酸三磷酸dNTP(dATP,dTTP,dCTP和dGTP)、目的基因、DNA聚合酶和引物构成的反应体系,当在每个体系中加入不同的双脱氧核苷三磷酸ddNTP,反应就会选择性的终止在A、T、C或G的位置上,我们根据不同ddNTP的颜色,在自动化的测序仪上就可以读出特定的核苷酸序列。因其使用简单、快速、准确率高,直到今天仍被称为基因检测的金标准。
01、检测已知胚系变异
一代测序可以用于检测乳腺癌或者卵巢癌病人家族中已知的BRCA1/2胚系突变,通过遗传咨询进一步判断是否需要对未发病的变异携带者提前采取预防或者干预措施。
02、分子诊断
根据CSCO胃肠间质瘤诊疗指南(2022),采用穿刺样本或者手术样本对KIT 基因9,11,13,17号外显子和PDGFRA基因12,14,18号外显子进行一代测序检测,可以辅助胃肠间质瘤的病理诊断(表格1,表格2)。此外,一代测序还可以通过对T细胞受体(T cell receptor, TCR)和B细胞受体(B cell receptor,BCR)基因重排的检测辅助淋巴瘤的诊断及预后判断。
03、指导靶向治疗
根据胃肠间质瘤指南和恶性黑色素瘤指南,KIT突变的患者可以用伊马替尼等靶向药物。在胃肠间质瘤中伊马替尼作为一线推荐,不同的分子亚型伊马替尼的剂量也不同。
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