遗传解读丨医生拿到遗传病基因检测报告怎么看?

　　基因检测应用在临床医学，已经有多年经验，帮助众多家庭找到明确的致病原因，许多罕见疾病的典型案例也发表在医学刊物上做以分享。

　　基因检测应用在医学领域可以辅助解决那些问题呢;首先，可以辅助临床医生进行疾病确诊，从遗传的角度鉴定遗传变异，根据结果可预测疾病的严重性和预后治疗效果;另外，基因检测可指导优生优育，对于有家族遗传病史或曾生育过患病孩子的家庭来说，很多有生育出健康宝宝的需求，基因检测可满足众多家庭的心愿，第一步需要通过基因检测找到明确的致病变异，第二步可通过三代试管或在孕中通过产前诊断来判断胎儿的携带情况，达到优生优育的目的。

　　越来越多的人群在了解到基因检测的意义后，会考虑选择从遗传的角度查询病因，患者在收到检测报告后到医生处进行疾病的确诊;对报告的分析及检出结果的致病性判断是最重要的环节，医生在此环节中起到决定性的作用，对医生的遗传学专业度要求越来越高。当拿到了患者的检测报告，如何看报告的结果呢，让小编带您来了解下。

　　临床上的疾病多种多样，根据每个疾病致病基因的不同变异形式，需要通过不同的技术手段或多种技术手段相结合的方式来检测，接下来会从技术手段来做介绍，同时列举常见报告做以展示。

　　技术一：二代测序技术

　　二代测序技术具有效率高、成本低的特点，特别适合微小变异的检测，也是临床上最常用的技术手段。多数疾病可通过此种技术来检测，有代谢性疾病、肌肉病、血液病、癫痫、皮肤病等。

　　示例1:患者2016年10月生，临床上出现语言发育迟缓、孤独症、脑积水、大头等临床症状，医生重点关注疾病为：发育迟缓、孤独症、代谢病、粘多糖病。经全外显子检测，得到结果如下：

　　结果版式说明：

　　主要分析结论为将检测结果做以汇总，展示在报告首页;会根据检出变异相关疾病与患者临床症状的相符程度及是否满足家族史等方面综合考虑，将结果分为3档，第一档：可以解释患者表型的致病性或疑似致病性变异，代表位于此档的基因变异是患者致病性变异的可能性较高，若临床符合，则高度可疑为阳性;第二档：致病证据不充分，但与患者表型较吻合，不排除致病可能的变异，此档变异检出，与患者临床可匹配到部分临床，但不足以支持为阳性结果，需要医生结合疾病与患者临床相符程度、遗传方式、家族史等方面综合分析致病性;第三档：其他结果，全外项目会免费赠送线粒体基因二代测序，其他项目根据实际检测内容添加此项结果。

　　检测结果分析：

　　对于阳性报告比较好分析，当症状高度相符、满足遗传方式、家族史等，高度可疑是患者的致病性变异;对于不明确的报告，需要从多角度考虑，常见的情况有以下几种：

　　1、仅送检先证者本人样本，检出结果与患者临床高度相似，未提供家系样本

　　建议补充样本进行家系来源分析，进一步通过临床症状、遗传方式、家族史等信息综合分析;

　　2、检出AD遗传疾病，先证者表型与此疾病高度相符，家系中同样位点携带成员无症状

　　可通过数据库或文献检索该基因是否存在不完全外显的请况，不完全外显代表由于修饰基因或环境因素的影响，使某基因的预期性状没有表现出来，基因的外显率降低，即存在携带但无症状的情况;若检索存在不完全外显的情况，此位点高度可疑;

　　3、检出AR遗传疾病，受检者仅检出一个位点变异，致病性评级较高，且患者临床与疾病症状高度相符

　　可通过数据库检索此基因除微小变异外，是否存在其他变异形式，如：基因的外显子缺失;若存在，可通过加做对应基因的MLPA或qPCR项目来进一步分析，同时进行家系来源分析;若先证者为携带，且满足AR遗传方式，高度可疑为疑似致病;

　　4、XLR检出男性半合子，遗传自母亲，母亲为杂合携带

　　对于女性来说，XLR遗传方式的相关疾病，女性杂合携带但不会有相应的临床症状，当其生育子代时，男性会有50%的患病风险，由于母亲无症状，不好分析位点的致病性;此时，可以结合母亲一系家庭成员的携带情况进一步分析，优先选择男性，如女方父亲、女方的哥哥、弟弟，通过家系中男性成员的携带情况来分析，若哥哥为同样携带，但无相似症状，可排除位点的致病性，若携带者与患者临床相似，此位点高度可疑;

　　5、检出结果与患者临床高度相似，不满足家系共分离

　　确认生物学家庭关系排除收养、非亲生、精子或卵子捐献以及其他非生物学关系，排除此种可能性。

　　技术二、MLPA

　　多重连接探针扩增技术(MLPA)是针对待检DNA序列进行定性和半定量分析的新技术。在单基因遗传病方面，用来检测基因的外显子缺失/重复，染色体片段缺失及甲基化等异常，适用于致病基因存在大片段变异的情况，常与二代测序或一代测序项目同时进行检测，常见疾病有：DMD、苯丙酮尿症、SMA、帕金森、天使人综合征、小胖威力综合征等。

　　检测结果：

　　发现受检者 DMD 基因 3-30 号外显子缺失变异

　　结果判读：

　　(1)横轴为探针编号，代表检测基因--所在外显子，例如：DMD-79，代表检测DMD基因79号外显子;

　　(2)纵轴为患者与对照样本荧光信号的比值;

　　(3)结果中的红蓝线为基准线，比值高于蓝线为重复变异，比值低于红线为缺失变异

　　(4)黄色圆点代表纵轴对应探针的检测情况

　　(5)灰色区域为试剂盒内设置的参考探针

　　小胖威力/天使人综合征(Prader Willi/Angelman Syndrome)大片段检测

　　检测结果：

　　发现受检者父源性 15q11-q13 片段缺失变异，父源性片段缺失会导致 Prader-Willi 综合征

　　结果说明：

　　此项目可同时检测染色体拷贝数及甲基化情况，一为检测染色体拷贝数，二为甲基化结果，对于天使/小胖疾病的判断，需结合两者的结果来综合判断，常见有以下的几种结果：

• 　　解读：母源单亲二倍体，导致小胖威力综合征
• 　　解读：父源15q11-13缺失型，导致小胖威力综合征
• 　　解读：父源单亲二倍体，导致天使人综合征
• 　　解读：母源15q11-13缺失型，导致天使人综合征

　　技术三、动态突变

　　动态突变又称为不稳定三核苷酸重复序列突变，是由于基因组中脱氧三核苷酸串联重复拷贝数增加，拷贝数的增加随着世代的传递而不断扩增，动态突变是导致人类遗传病的一种新的基因突变类型。常见疾病有：脊髓小脑共济失调、亨廷顿病、脆性X综合征等。

　　示例1：亨廷顿舞蹈症动态突变检测

　　结果说明：受检者HTT基因对应的重复数分别为20及44，在文献报道中当重复数大于36时为患者，受检者检出结果中44>36，考虑HTT基因相关疾病亨廷顿病为AD遗传，当其中一个重复数大于阈值时，会导致疾病的发生。

　　总结

　　临床上疾病复杂多样，单基因遗传病是目前医学领域研究比较多的一类，也取得了可喜的进展，基于目前研究明确的基因和疾病，可以通过不同的技术手段来辅助临床确诊。阳性结果可为医生和家族成员提供有用的信息用于疾病治疗、预后和风险评估;临床意义不明的位点需要通过多方面的考虑进一步分析，是否有其他考虑方向，是否有进一步检测的必要性;阴性结果，可以认为极大降低了遗传性疾病的风险，基本排除检测范围内基因的致病性。

　　随着医学探索的逐步深入，及广大医学工作者在遗传领域的学术研究，相信在不久的将来会解锁更多未知区域，给目前未找到明确致病基因患者带来曙光，同时为疾病的确诊带来更多的可能性。

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