亲子鉴定_基因检测_体外诊断IVD知识库-新纪元基因网

手机版

当前位置:首页 >  体外诊断 >  科技前沿

一文读懂 | NGS基因检测对肿瘤患者的意义

更新时间:2023-07-16 21:37:19发布时间:24小时内人气:1作者: 会员上传

癌症是最常见的基因疾病,尽管不同癌症有不同的诱因和症状,但都可以通过基因突变得到解释。那么,基因检测对于肿瘤患者的诊治究竟有怎样的意义?关于癌症基因检测,我们还需要了解什么?今天,为您一一详解。

01.question

什么是NGS测序?准确性如何?

NGS即高通量测序(High-Throughput Sequencing),是Next Generation Sequencing(第二代测序)的缩写。所谓第二代是相对于一代Sanger Sequencing(桑格测序)来说的。NGS是肿瘤领域非常重要的技术平台,能够帮助医生在较短时间内准确、详细地了解患者肿瘤细胞的DNA突变情况,辅助指导临床用药。目前,对肿瘤组织做NGS测序是肿瘤领域的金标准之一。

在临床实践中,NGS检测使用的样本,首选是肿瘤组织,可直接检测到肿瘤细胞的DNA变化。不过,肿瘤组织取样也存在局限:

1) 肿瘤组织不同部位存在异质性,活检取得的组织有限,不可能覆盖肿瘤的所有部位,则相应检测的结果并不能完全代表整个肿瘤组织的遗传信息表达,也就是说,不同医生、两次取样,所得出的检测结果可能存在或大或小的差异。

2) 对于部分危重患者,活检存在一定的手术风险,或者某些患者拒绝活检取样。

3) 如果所取样本不合格,可能要二次活检,无疑给患者的病情雪上加霜。

除了组织样本,患者的外周血(除骨髓外的血管中的血液)。因肿瘤细胞可释放DNA进入血液循环系统,通过采集血液也可获取肿瘤细胞DNA的遗传信息变化。但如果肿瘤细胞没有释放DNA进入血液循环系统,或者释放的量低于检测下限,就无法依赖于外周血样本的 NGS 检测来获取肿瘤组织的遗传信息。

无论是组织还是血液,只要采样符合标准,那么其分析结果就是相对可信的。当然,这两种采样方法的NGS测序结果不完全一致,在临床应用时,有条件的可同时采集,作为相互补充,使分析所得的肿瘤细胞遗传信息更完整。

02question

肿瘤患者确诊后,是否必须做NGS检测?

癌症的治疗一定是越快越好。那么,通过单基因或小Panel检测,可以快速地明确患者是否携带该用药靶点,并且,这类检测价格也相对便宜。但是,更全面的上百个靶点的测序,耗时更长,价格也更贵。

这里就存在一个实际问题:如果患者在整个治疗过程中需要用多个不同的靶向药物,但一次活检所采集的组织样本也只够一两次检测使用,如果样本耗竭,就需要重新采样,姑且不说患者是否有那么多样本供采集,反复活检给患者带来额外的伤害和风险,显然不可取。此时,NGS测序一次即可提供全面信息的优势就体现了。

临床决策不是简单的对错题,医生需要对患者的实际情况有非常完整的了解,特别是要明确做NGS检测的目的,如果只是当作一种手段的话,完全可以用其他常规检测方法取代。

所以,答案很明确,肿瘤一线治疗不依赖NGS检测。比如胃癌的一线治疗,重点就在于患者是否有HER2扩增,这通过常规的病理检测即可,已足够指导临床决策。但是,在一些癌症晚期患者中,可能出现指南药物都无效的情况,用NGS探索其他靶向药物的可能性,是可以帮助患者最大限度争取新的治疗方法和更好的预后。只是,这需要和患者或家属充分沟通,说明利弊,最终由患者或家属做决定。

03question

使用靶向药物之前,是否必须做NGS检测?

靶向药物按靶点类型可分成两大类:一类是单靶点药物,一类是多靶点药物。

| 单靶点药物

举例来说,针对肺癌的ALK突变,要使用ALK抑制剂,就必须精准检测,证明ALK靶点存在。通过NGS检测,可以为患者精准匹配相应靶点靶向药物。当然,精准检测不等于只能用NGS,常规的免疫组化或另一项“金标准”FISH有时也能办到。比如乳腺癌中常见的HER2基因,临床上一般用免疫组化就能够检测是否阳性。

NGS在某些基因变异的检测中有优势,比如针对泛癌种的NTRK融合,要使用拉罗替尼,NGS就是首选。这是因为NTRK融合在人群中的比例低,常规检测手段不易检出或容易漏检。

| 多靶点药物

对于多靶点药物,临床上并不依赖肿瘤DNA的精准检测。多靶点药物缺乏有效的预测性标志物,往往对VEGFR-2 在内的多个靶点都有抑制作用。比如肝癌,医生选用索拉非尼等药物不需要NGS的检测结果,或者说,检测出其他突变基因,不影响选用索拉非尼。

当然,随着靶向新药的不断增多以及适应症的不断增加,NGS检测所提供的突变图谱还是有助于医生针对性地制定用药方案。

04question

在肿瘤患者的临床诊疗中,专家共识和指南有什么作用?

同一种肿瘤在不同人群中的特征是不一样的。比如胆管癌,中国人群肝内胆管癌发病率高于肝外胆管癌,西方人群则以胆囊癌多见。所以,国家对药物审批、适用人群的规定不同,需要制定和遵循不同的指南。在美国应用最广的是NCCN指南,在中国主要遵循中国临床肿瘤学会(CSCO)制定的指南,两者都具有较高的权威性。

指南是过往诊疗经验的“集大成”,对当今整个肿瘤学来说非常重要临床意义。遵循指南的指导实际上是肿瘤治疗的标准化,有助于提高诊疗质量,帮助患者最大程度获益,规避过度和不规范的治疗。

在整个医学界,肿瘤学是一门年轻的学科,其建立和应用与探索是并行的。指南固然权威,但也存在不足,所以才需要不断更新。比如NGS检测,作为一项重要的检测手段被写入多个癌种的指南。

05question

如何看待“超适应症用药”?

“超适应症用药”也叫“超指南用药”,一般指在指南标准治疗建议以外,为患者提供的治疗方案。对于已接受多线标准治疗方案,但病情未能控制的患者,“超指南用药”的目的是为患者争取生存的可能。

这一初衷是好的,但存在几个需要注意的问题:

1) “超适应症用药”不能脱离循证医学,也不能是单纯的经验性尝试,应当基于现有可能获益的临床研究数据为患者选择合适的治疗方案,尤其是来源于较高等级杂志上发表的或大型国际会议中的数据,具有更高的参考价值。

2) 在治疗过程中,应当对“超适应症用药”做安全性、有效性的全面记录,一方面可以更好地平衡患者的风险和收益,另一方面也能积累宝贵的临床数据。

3) 医院层面对“超适应症用药”需要有明确清晰的监管,包括设立多学科团队、制定药物审批流程和伦理委员会审查等。其目的为患者避免过度治疗,降低患者在不确定受益的前提下所面临的风险。

指南制定总是滞后于临床实践,“超适应症用药”往往是无奈之举,通俗来讲就是“放手一搏”。因此,医生给患者使用指南推荐以外的药物,就必须系统性地收集和评判治疗效果,并且在外部要有个透明的、管理恰当的管理监督系统,这既是对患者生命的负责,也是对医生医疗行为的负责。

06question

目前NGS检测大多由第三方公司提供,如何选择?

首先,从医院角度:NGS 检测结果的准确性和活检取样的质量强关联。患者的样本在送去第三方公司检测前,会先由病理科医生初步评估,判断标本是否有否满足检测需求。一般来说,公立医院对各类第三方检测机构都有详细调查,综合其资质、业界口碑、既往检测质量等参数予以评估,并定期考核、验证。

另外,要看这个检测公司的实验室是否拥有美国CAP、CLIA双认证资质,定期参与并通过国内外的质量评估(如美国CAP,欧洲EMQN,中国国家卫生健康委临床检验中心NCCL)。如果都有,那么基本就是可靠的。

推荐阅读:

  高科技!基因检测助力血液肿瘤患者治疗

  发病率超白血病,这种易被忽视的“恶性血液肿瘤”要警惕

  NGS最新共识!二代测序技术在血液肿瘤中的应用中国专家共识(2018年版)