精准医学背景下,NGS已发展成为癌症精准诊疗的核心技术,为癌症患者,特别是晚期癌症患者开辟了一个精准诊疗新框架。那么,基于NGS的诊疗是否真的带来了临床获益?是否延长了癌症进展的时间(PFS)和/或增加总生存期(OS)?
随着科技的进度,癌症治疗领域迎来了前所未有的发展机遇。基于NGS(Next Generation Sequencing,二代测序)的基因检测技术革新了临床癌症精准诊疗路径,并迅速成为晚期癌症患者的管理标准之一。
NGS与癌症靶向治疗之间的关系密切。2020年,通过NGS识别的28种靶向疗法获得了FDA的批准1 ,并且越来越多的临床试验使用NGS来确定患者的入组资格2 。美国临床肿瘤学会(ASCO)近期发布了一份临时临床意见(2022),概述了针对转移性或晚期癌症患者进行基因检测的建议,包括推荐NGS多基因panel检测,以识别靶向药物的靶标情况3 。虽然先前许多研究已经证明在特定环境下NGS检测的临床价值和经济价值。但截至目前,尚未有综合性研究总结在多种肿瘤类型患者中接受 NGS-informed 靶向治疗的PFS和OS情况。
2023年6月7日,《临床肿瘤学杂志·精准肿瘤学》(JCO Precis Oncol)发表了一篇综述,全面回顾了NGS对晚期癌症患者的治疗临床效用:研究者通过比较在NGS检测基础上接受靶向治疗的患者与未接受靶向治疗的患者的无进展生存期(PFS)和/或总生存期(OS),结果发现NGS-informed靶向治疗的癌症患者的PFS和OS显著延长4。
方法
研究者在2021年8月6日利用PubMed检索了5年内(2016年8月7日-2021年8月6日)发表的有关“利用NGS检测晚期(III期或IV期)、转移性、难治性或复发性成人癌症患者PFS和OS”的英文期刊出版物 5,854篇;并且还于2021年11月29日利用Embase检索了2020年和2021年在ASCO、ESMO和WCLC会议上发表的会议摘要 621篇,合计 6,475篇。
研究者提取了以下内容进行分析:研究设计、研究群体、NGS检测前接受的治疗路线、临床试验登记、接受NGS检测和靶向治疗的患者人数、OS、PFS、肿瘤反应、接受的NGS检测类型和NGS检测特征(如检测的基因数量和来源类型,组织/血液,DNA/RNA)。统计学意义定义为 P<0.05。
经过两个筛选阶段和数据提取,29篇期刊出版物和2篇不重叠的会议摘要(合计31篇)符合标准并被纳入分析:21篇(68%)采用回顾性观察队列设计、5篇(16%)采用前瞻性观察队列设计、5篇(16%)采用非随机临床试验。
结果
1、存活率结果
接受NGS检测的患者中,平均29%有针对性的靶向疗法(匹配疗法或临床试验)。未接受靶向疗法的原因有多种,包括没有可用的靶向治疗(没有可操作基因突变等),医生选择替代治疗,患者进展或死亡,患者拒绝治疗,或患者失去随访等。
31项研究评估了接受NGS-informed靶向治疗的癌症患者亚组的PFS和OS。在不同肿瘤类型的11篇和16篇期刊出版物中,那些接受NGS-informed靶向治疗患者的PFS和OS显著延长。
2、NGS检测特征
38%的患者仅做了1次检测,62%的患者做了1次以上检测。NGS检测panel,最小基因数为11基因,最大基因数为596基因。检测样本类型为组织和/或血液(体液),核酸类型为DNA或DNA+RNA。
结论
综合而言,用NGS检测来确定匹配的靶向疗法会对癌症患者的PFS和OS产生影响。超过一半的研究报告称,接受NGS-informed靶向治疗的患者PFS和OS显著延长。
NGS对晚期肿瘤患者的作用
2021年2月25日,《JAMA Oncology》在线发表了NGS在晚期实体肿瘤中的临床价值评估5。该研究使用NGS对1,000余名晚期或转移性癌症患者的DNA(WES和1,700基因靶向panel)和RNA(肿瘤转录组)进行了测序检测,并评估治疗反应和临床获益情况。
结果显示:
1)在80.5%的患者中发现了潜在的可操作的基因组变异;
2)在接受NGS-informed靶向治疗患者中,37.1%患者取得了临床获益,19.7%的患者获得了超级应答(疾病控制至少一年);
3)对于原发灶不明癌患者,在50.9%的病例中,NGS解决了组织溯源问题,为医生提供更好的线索,了解哪些标准疗法和靶向疗法可能会有所帮助;
4)在15.8%的癌症患者中发现了潜在的可遗传胚系致病变异(增加患癌风险),其中4.8%与靶向治疗相关。
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